كما هو الحال مع أي فحص، توجد إيجابيات وسلبيات لبرنامج فحص سرطان القولون.  وبالرغم من أن الإيجابيات تفوق السلبيات بكثير، إلا أنه لا يزال من المهم التعرف عليها جميعًا حتى تتمكن من اتخاذ قرار المشاركة من عدمه بنفسك.